Microbiote intestinal : qu’est-ce que c’est ? 

Le microbiome est le terme collectif pour tous les petits organismes de notre système intestinal.

Ce sont des bactéries, des virus et des champignons qui vivent souvent en permanence dans nos intestins. L'attention portée au microbiome a rapidement augmenté ces dernières années, car on en sait de plus en plus sur l'effet de notre microbiome sur notre santé.

Le test maison du microbiome est aussi l'un de nos tests les plus populaires pour cette raison. Il permet d’établir un profil détaillé de votre microbiote, ce que les résultats signifient pour votre santé et comment l’améliorer. 

Un microbiome équilibré renforce votre santé, votre vitalité et votre énergie. À l'inverse, un déséquilibre du microbiome peut avoir des répercussions négatives sur votre santé globale.

Découvrez pourquoi votre microbiome est si important et apprenez à en prendre soin au quotidien. Nous vous donnons toutes les clés pour une santé optimale.

Mais d'abord, commençons par un peu de contexte sur le microbiome. De quoi parlons-nous exactement ? Qu'est-ce que le microbiome et pourquoi est-il si important pour notre santé ?

Lorsqu'il est question de bactéries, beaucoup pensent à la saleté et aux maladies, mais de nombreuses bactéries de notre intestin sont en fait très utiles.

Le microbiome est très vaste. Pour vous donner une idée, le corps est composé d’environ 30 000 milliards de cellules. Le microbiome est composé d'au moins autant de micro-organismes. Nous hébergeons donc au moins autant d'organismes que nous avons de cellules corporelles. Certaines bactéries vivent sur les cellules de la paroi intestinale, tandis que d'autres se trouvent dans le côlon.

Bactéries bénéfiques dans nos intestins

Lorsqu’il est question de bactéries, beaucoup pensent à la saleté et aux maladies, mais de nombreuses bactéries présentes dans notre intestin sont très utiles. Par exemple, en fabriquant ou en décomposant toutes sortes de substances.

Ces “bonnes bactéries” exercent également une action protectrice en limitant la prolifération des bactéries pathogènes. En effet, les ressources disponibles dans l’intestin (espace et nourriture) sont très limitées. Et lorsque celles-ci sont déjà utilisées par les bonnes bactéries, alors les mauvaises bactéries ont plus de difficultés à s’établir et à se développer. 

Pour illustrer ce phénomène, imaginez une situation courante dans les transports en commun. Si vous voyagez dans un wagon plein et qu'un individu en état d'ébriété cherche à s'asseoir à côté de vous, vous serez soulagé si la place est déjà occupée.

De la même manière, certaines bactéries de notre microbiome occupent l'espace et utilisent les ressources de notre intestin, empêchant ainsi d'autres bactéries, potentiellement nocives, de s'y installer et de provoquer une infection.

Plus d'informations sur les bactéries étudiées

Une étude du journal Microorganisms a étudié l'impact des bactéries gastrointestinales sur la santé et les maladies. Bien que nous utilisions le terme “espèce” par commodité, il s’agit en réalité de différents genres bactéries, qui partagent une tribu commune appelée phylum.

Bactéries Firmicutes

Les Firmicutes sont un ensemble de bactéries, dont le rôle est similaire. La flore intestinale des personnes d'origine occidentale est largement composée de ces bactéries.

• Anaerostipes
• Blautia
• Dorea
• Flavonifractor
• Lactobacillus
• Pseudo-butyrivibrio
• Roseburia
• Ruminococcus
• Sarcina
• Faecalibacterium prausnitzii

Certaines de ces espèces bactériennes sont fortement associées à votre santé. La plus connue est Faecalibacterium prausnitzii, cette bactérie peut parfois représenter jusqu'à 20% de toutes les bactéries intestinales dans l'intestin et est connue pour ses effets anti-inflammatoires. 

Par conséquent, si vous avez un faible taux de faecalibacterium prausnitzii, il peut être utile d’évaluer la présence d’une inflammation dans votre intestin. Nous pouvons le faire grâce à un test intestinal à la calprotectine.

Ce test recherche des marqueurs inflammatoires dans vos selles. Par ailleurs, prausnitzii est important pour la production de butyrate. Le butyrate est un bon nutriment pour vos cellules intestinales et contribue donc à un intestin sain. Une autre espèce bactérienne de ce groupe est Christensenella minuta.

Une étude menée auprès de 977 volontaires a révélé que les personnes possédant une forte quantité de Christensenellaceae ont davantage de chances d'afficher un IMC (indice de masse corporelle) bas. Cela indique qu'elles sont moins susceptibles de souffrir d'obésité et suggère que ces bactéries pourraient jouer un rôle important dans la santé métabolique.

Bacteroidetes

C'est le deuxième groupe le plus courant au sein des populations occidentales. Chez les populations non occidentales, c'est généralement le groupe le plus courant. Il s'agit généralement de bactéries en forme de bâtonnets. Les espèces les plus courantes sont Prevotella, Alistipes et Bacteroides.

De nombreuses autres espèces de ce groupe ne sont généralement pas présentes chez les personnes en bonne santé. Parce que beaucoup de ces espèces sont des bactéries défavorables.

Actinobacteria

Ce groupe ne représente souvent que quelques pour cent de l'ensemble des bactéries présentes. Les espèces les plus connues sont Collinsella et les Bifidobactéries.

Les bifidobactéries en particulier sont connues des yaourts probiotiques sains ou des suppléments probiotiques.

Proteobacteria

Ce groupe bactérien n'est pas non plus très courant. Les espèces les plus connues sont Eschericha Coli (E-Coli) et Helicobacter pylori. Si de nombreuses souches d'E. coli sont inoffensives, certaines sont associées à des intoxications alimentaires. Helicobacter pylori est quant à elle liée aux ulcères d'estomac.

De manière générale, les protéobactéries ne sont pas bénéfiques pour la santé humaine. D'autres exemples bien connus sont la Salmonelle et le Campylobacter, également responsables d’intoxications alimentaires.

Pourtant, toutes les protéobactéries ne sont pas mauvaises pour notre santé ; par exemple, Sutterella wadsworthensis est une protéobactérie souvent présente chez les personnes en bonne santé.

Verrucomicrobia, Akkermansia

La bactérie la plus connue de ce groupe est Akkermansia Muciniphila. Cette bactérie, présente chez environ 90% de la population, joue un rôle crucial dans la santé de la paroi intestinale. Si la paroi intestinale produit trop de mucus, la bactérie Akkermansia le décompose. De plus, cette bactérie a des propriétés anti-inflammatoires et plusieurs études ont établi un lien entre l'Akkermansia et la réduction du risque du syndrome métabolique.

Si vous n’avez pas cette bactérie, sa fonction est souvent reprise par d'autres bactéries. C'est en partie pourquoi un indice de diversité élevé est si important. Si de nombreux types de bactéries différents vivent dans votre intestin, les chances d’atteindre un équilibre sont plus grandes. Il est toujours possible d’effectuer un test de zonuline pour vérifier le bon fonctionnement de votre paroi intestinale.

Le microbiote est un monde à part entière; c'est un écosystème complet

Tous les micro-organismes forment collectivement un écosystème complet qui se maintient et s'adapte aux conditions. Cela signifie que la composition de notre microbiome se façonne en fonction de choses comme les aliments que nous consommons et l'état de santé de notre organisme.

Et ce n’est pas un rapport à sens unique ! Le microbiome a aussi beaucoup d'influence sur notre constitution.

Certaines bactéries présentes dans l’intestin produisent des substances essentielles pour l’organisme, comme la vitamine K. Cette vitamine a son rôle dans la coagulation du sang. Sans les bactéries qui la fabriquent, vous pourriez rencontrer des problèmes de santé. C'est pourquoi les bébés, dont le microbiote intestinal est encore en développement, reçoivent de la vitamine K à la naissance, dans le lait maternel.

À l'inverse, un déséquilibre dans le microbiote peut entraîner des problèmes de santé. Si certaines bactéries se multiplient de manière excessive, elles peuvent produire des substances nocives pour l’organisme. Ou bien, elles peuvent consommer des nutriments dont vous avez besoin, ce qui peut provoquer des carences.

Par exemple, la bactérie Faecalibacterium est bénéfique car elle produit de l'acide butyrique, une substance qui nourrit les cellules de l’intestin. En revanche, un excès de Clostridium difficile, une bactérie qui provoque une diarrhée légère ou grave, peut irriter votre intestin et causer des problèmes digestifs.

Il ne s’agit donc pas seulement de savoir quels micro-organismes sont présents, mais aussi de connaître leur quantité respective. Cet équilibre est essentiel pour maintenir une bonne santé globale. 

Diversifié et varié

Diverses études ont montré qu'un microbiome sain se compose de nombreux micro-organismes différents (les estimations vont parfois jusqu'à 1 000+ espèces différentes), qui s'équilibrent les uns les autres. Tous ces micro-organismes interagissent entre eux et avec notre corps. Dans son ensemble, l'écosystème change de composition lorsque ses conditions changent.

Un microbiome sain est donc diversifié et équilibré. Malheureusement, ce n'est pas toujours le cas. C'est pourquoi nous entendons de plus en plus parler du microbiome. Lorsque cet équilibre est perturbé, c'est-à-dire lorsqu'un micro-organisme est trop présent ou au contraire absent, cela peut avoir des conséquences bien au-delà de nos intestins.

De plus en plus de professionnels de santé se penchent sur l'état du microbiome. Même si leurs méthodes et leurs approches diffèrent, tous reconnaissent l'importance du microbiome pour notre santé.

Test en auto-prélèvement du microbiote

Qu'est-ce qui est bon pour le microbiote?

La composition de votre microbiome peut changer. Et la façon dont cette composition change dépend en partie de vous. Alors comment favoriser un microbiome en bonne santé ? Comment favoriser la croissance des bonnes bactéries et limiter les mauvaises ? Pour cela, il est recommandé de : 

• Pratiquer une activité physique régulière
• Dormir suffisamment
• Gérer votre stress

Cependant, le plus important reste l’alimentation. Ce que vous mangez impacte l'équilibre de votre microbiote. En consommant :

• Des fibres,
• Des produits complets,
• Des fruits et des légumes. 

Vous nourrissez les bonnes bactéries.

Un test du microbiote peut vous apporter plus rapidement des informations précises sur vos besoins. Par exemple, il peut vous indiquer si vous devez consommer plus d’aliments riches en oligofructose (comme les poireaux, les oignons ou les asperges) ou plus de prébiotiques comme les choux, les brocolis ou la chicorée. 

Plus haut, vous avez pu en savoir plus sur les bonnes bactéries intestinales et leur importance pour votre santé. En effet, les recommandations diététiques sont liées aux bactéries présentes dans l’intestin, qu’elles soient en grande ou petite quantité. Comment exactement ? Les images ci-dessous vous donnent un aperçu. 

Conseils pour un microbiote sain et une meilleure santé

Si vous ressentez des symptômes qui reviennent souvent ou de manière irrégulière et que vous ne parvenez pas à en comprendre l'origine, il est possible que votre flore intestinale soit déséquilibrée. C'est ce qu'on appelle une dysbiose.

Notre article sur "comment améliorer son microbiote intestinal" vous éclaire sur le sujet. Sachez que ce déséquilibre n’affecte pas seulement la digestion, mais peut aussi entraîner des troubles immunitaires ou même des problèmes d’humeur.

Si vous avez une carence en certains nutriments, la cause peut aussi être liée à ce déséquilibre. La présence de trop ou de peu de bactéries peut perturber tout votre organisme.

Comprendre la composition exacte de votre microbiome peut être la première étape vers le bien-être global. Alors, vous avez des problèmes qui pourraient être causés par le microbiome, ou vous vous intéressez simplement à votre santé ? Alors nous serons heureux de vous aider !

Commandez l’un de nos tests ou contactez-nous pour plus d’informations. Nous sommes à votre disposition ! 

Mieux comprendre son microbiote